X-ファイル ザ・ムービー

テキサス北部で少年（ルーカス・ブラック）が謎の死を遂げ、彼を助けようと現地の消防団員も姿を消すという不思議な事件が起きた。1週間後、ＦＢＩ捜査官フォックス・モルダー（デイヴィッド・ドゥカーヴニー）とダナ・スカリー（ジリアン・アンダーソン）は、一連の事件と宇宙人たちと内通する謎の組織が関連していることを突き止めるが、スカリーは何者かに誘拐されてしまう。モルダーは、謎の組織の中心人物（ジョン・ネヴィル）にスカリーの居場所が南極だと知らされる。南極には人間を栄養にし宇宙人を育てるシステムが稼働した基地があったのだ。スカリーを助け出すと、その基地はＵＦＯに姿を変え、飛び去ってしまうのだった。