책읽기를 너무나 좋아하는 다진이와 미나. 책을 읽고 싶지만, 그럴 환경이 안 되는 다진이와 미나에게 비밀의 도서관에서 초대장이 날아온다. 보름달이 뜨는 밤 학교 운동장 0.7의 자리에 있으면 올 수 있다는 것. 다진이와 미나는 혹시나 하고 보름달이 뜨는 밤 학교 운동장을 찾아간다.
그리고 순식간에 비밀의 도서관으로 향하게 되고, 도서관지기인 책즘일키오 아저씨를 만난다. 책즘일키오 아저씨에게 비밀의 도서관에 대한 설명을 듣고, 다진이와 미나는 그동안 상상조차 못했던 신비스럽고 당황스러운 일들을 경험하게 되는데...
1. 학교 도서실
2. 초대장
3. 학교 운동장의 0.7
4. 책벌레들
5. 걸어다니는 책장과 날아다니는 책
6. 추억의 열람실
7. 사라진 책들
8. 마법의 화원
9. 첫 번째 시험
10. 두 번째 시험
11. 꽃의 눈물
12. 마지막 시험
13. 되돌아온 소녀
14. 이별은 아쉽지만 더 큰 기쁨이 있기에
