ズートピアは、かつての肉食動物も草食動物も、大きな動物も小さな動物も、あらゆるタイプの動物たちが平和に暮らす超ハイテクな文明社会で、“誰でも夢を叶えられる”という理想の楽園だ。そこで暮らすズートピア初のウサギの警官・ジュディ(声:上戸彩)は、前向きで夢を信じている。元詐欺師で皮肉屋だけど頼れるキツネの相棒・ニック(森川智之)は何もかも正反対だが、ふたりは特別な絆で結ばれていた。ある日、ズートピアに突如現れたヘビのゲイリーをきっかけに、ふたりは再びバディを組んで潜入捜査を行い、ズートピアの過去に秘められた巨大な謎に挑むことになる。そこにはふたりの絆が試される、ズートピア最大の試練が待ち受けていた……。