白熱の期末試験が終わり、夏休みの林間合宿を控えた雄英高校のメンバーたち。そんな折、デクこと緑谷出久（声：山下大輝）とオールマイト（声：三宅健太）は、ある人物から招待され、海外に浮かぶ巨大人口都市I・アイランドを訪れていた。そこは、世界中の科学研究者たちの英知が集まったまさにサイエンスハリウッドのような島。個性やヒーローアイテムの研究成果を展示した《I・エキスポ》が開催される中、デクは“無個性”の少女メリッサ（声：志田未来）と出会う。彼女にかつて同じ“無個性”だった自分を重ねあわせるデク。だがその時、突如鉄壁のセキュリティを誇るアイランドの警備システムが敵（ヴィラン）にハッキングされ、島内の人間全員が人質に獲られてしまう。そして、ヒーロー社会の構造を揺るがしかねないある計画が発動する……。