突如タケル（西銘駿）たちの前に仮面ライダーダークゴーストが現れる。タケルがダークゴーストを追って七色の光の中へ入っていくと、歴史上の英雄たちの魂が実体化して暮らしている不思議な村があった。ダークゴーストの目的は、100人の英雄の眼魂を集めて究極の眼魂を完成させ、世界中の人間を魂だけの姿、つまりゴーストにすることだった。