主人公、ジェファーソン･ピアースは秘密を抱えている。犯罪組織に牛耳られた街で若者の避難場所の役割を果たす高校の校長として、今でこそ“地元のヒーロー”だが、９年前までは電撃を自在に操れる能力を生かし、“ブラックライトニング”として街の安全を守っていたのだ。しかし、もう１人の自分が家族を傷つけ悲しませていることを知ったジェファーソンは、スーパーヒーローとしての生活に別れを告げ、校長兼父親という役割に落ち着いた。だが、彼の大切な人々が犯罪組織に狙われていることを知り、ブラックライトニングはついに戻って来る――家族と人々を守るために。