伊藤淳史と仲村トオル主演による『チーム・バチスタ2 ジェネラル・ルージュの凱旋』の続編。コンビナート爆発炎上事故の対応に追われる東城医大。そんな緊急事態の中、“ジェネラル・ルージュ”速水の下に、ICU患者の死を予告する1通の怪文書が届く。