J.J.エイブラムス製作総指揮で贈る科学サスペンスの第4シーズン。フリンジ・チームはシェイプシフターについて調査を進める。そんな中、あることがきっかけとなり、リンカーン・リー捜査官がチームの捜査に加わることに。