エイミー、ローリー、リヴァー・ソングの三人をアメリカ・ユタ州の砂漠に呼び出したドクター。だが、そこにあるシレンシオ湖で、湖の中から現れた宇宙飛行士によってドクターが殺されてしまう。殺されたのは未来のドクター。三人はドクターが残したメッセージに従い、殺される前の若いドクターとともにタイムトラベルをする。その後、この事件でリヴァーが取った行動が時間を崩壊させる危機もたらすことになり…。