<킬링 지저스>는 예수가 태어났던 시대, 헤롯 왕이 유대를 통치하던 시절로부터 그 이야기가 펼쳐진다. 헤롯 왕은 언제나 자신이 행사하고 있는 권력을 놓칠까 불안해했고, 동방 박사가 ‘새로운 유대인의 왕’을 보러 갔다는 소식은 헤롯 왕의 불안감을 자극해 베들레헴의 2살 미만 남자 아이를 모두 죽이라는 잔인한 명령으로 이어졌다. 하지만 어린 예수와 그의 가족들은 이미 탈출한 뒤였다. 26년 후, 예수는 그의 메시지를 전파하기 시작하고, 신실한 신자(信者)들을 모으기 시작한다. 동시에, 새로운 정치 권력으로 떠오른 헤롯 왕의 아들 안티파스와 로마가 임명한 총독 본디오 빌라도는 예수의 영향력이 커져가는 것을 우려한다. 유대교의 리더 가야바와 안나스는 예수의 가르침과 방법에 의심을 품는다.
