남태평양 피지 제도의 섬 중 하나는 파고파고섬에 이주해온 일본의 해양생물학자 오바타 테츠로와 아들 요스케. 이주해온지 3년이 지난 어느날 아침. 폭풍이 지나간 산호 해변에서 요스케가 50cm 정도 크기의 생물을 발견한다. 그것은 1억 6500년 이전에 존재했던 수장룡 플레시오사우르스의 새끼였다. 요스케는 스스로 이 아이의 어머니역을 하겠다고 다짐하고 연구소로 데려와 '쿠'라는 이름을 붙여준다. 같은 시각, 쿠의 어머니인 플레시오사우르스의 시체가 다른 섬에서 발견된다. 그리고 프랑스의 핵실험계획을 둘러싼 국가 정보기관의 암약을 알게되고 결국 총을 들게된다.
