전광초인 그리드맨

쇼 나오토, 바바 잇페이, 니오우에 유카 세명은 사쿠라가자카 중학교에 다니는 중학교 2학년 동급생이다. 삼총사는 잇페이의 부모님이 운영하는 인테리어점 지하에 자신들만 아는 비밀 연구소를 만들어 놓는다. 중고 파츠를 모아서 조립한 컴퓨터 '잭'을 중심으로 연구와 개발이 매일같이 이어져갔다. 토도 타케시도 나오토의 같은반 학생이지만 음침한 성격으로 친구도 사귀지 않고 컴퓨터 오타쿠처럼 방 안에만 머물러 있었다. 타케시가 유카의 집에 괴수 기랄스를 이용해 해킹을 시도한 그 때에, 타케시의 눈 앞에 마왕 컨데지퍼가 나타난다. 컨데지퍼는 '하이퍼 월드'라 불리우는 이차원공간으로부터 도망온 악마로 타케시의 컴퓨터에 기생해 '컴퓨터 월드'를 발생시킨다. 타케시의 부정적인 감정을 빨아들인 컨테지퍼는 타케시를 자신의 마음대로 조종하고 괴수를 만들게 하여 지구를 정복하려 한다. 나오토 일행이 컴퓨터 월드의 이상을 눈치챘을 때, 켄터지퍼를 쫓아 지구에 온 하이퍼 에이전트가 잭 속에 CG로 그려진 '그리드맨'에 탑승해 전광초인이 된다. 나오토는 그리드맨과 함께 컨테지퍼와 싸우기 위해 그리드맨과 합체하기로 결심한다. 이렇게 그리드맨과 컨테지퍼의 싸움이 시작된다.