신오지방 챔피언인 난천과 다시 만나게 된 지우와 친구들은 난천과 함께 하나지방의 동쪽에 있는 지역으로 여행을 떠나게 된다! 그 곳에는 망나뇽과 리오르, 이브이 등 하나지방 이외의 여러 포켓몬들과 지우와 신오지방에서 모험을 함께 했던 동료인 빛나와 팽도리의 모습도 보이는데… 그리고 환상의 포켓몬 「메로엣타」가 친구가 되어 지우와 친구들의 대모험이 시작된다!