이곳은 사람과 몬스터가 공존하는 세계. 몬스터를 사냥하는 자들을 헌터라고 부른다. 그 헌터들의 세계 한편에 몬스터와 인연을 맺고 함께 살아가는 자들인 라이더가 있다. 라이더는 몬스터에게 숨겨진 힘을 눈뜨게 할 수 있는 ‘인연의 돌’을 지니고, 인연을 맺은 ‘오토몬’과 은밀히 살아가고 있다. 라이더 마을인 ‘하쿰 마을’에 사는 소년 류트의 꿈은 ‘세계 최고의 라이더’가 되는 것. 12살이 된 류트는 ‘인연의 돌’을 받는 의식을 치르기 전에 최초의 ‘오토몬’을 스스로 찾아내려 한다. 마음 착한 소꿉친구 슈벨과 호기심 많은 리리아, 류트의 촐랑이 단짝 네비루와 함께 숲속 깊이 발을 들여놓은 류트는 그곳에서 리오레우스와 기적적으로 만나게 된다. 이제 라이더와 몬스터의 인연을 잇는 이야기가 지금 시작된다.
