기억을 되찾기 위하여 싸움을 반복하던 아이언 걸, 사오토메 크리스(아스카 키라라)는 자신에게 도움을 요청하는 소녀의 목소리에 고민하고 있었다. 어느 날 자경단 ‘레지스탕스’ 대원 카츠라기 조(아오야기 타카야)를 만나 그와 함께 지내게 된다. 한편 최강의 사이보그가 된 다이아나(아카이 사키)는 테러 조직 ‘알카로이드’의 일원이 되어 크리스의 목숨을 노리고 있는데… 알카로이드와 레지스탕스의 공방이 이어지던 와중에, 크리스는 자신에게 도움을 요청하던 수수께끼의 소녀 사라(아마키 준)를 만나게 된다.