평범한 고등학교 2학년 학생인 콘노 마코토는 어떤 사고를 계기로 본의 아니게 시간을 이동하는 능력을 얻게 된다. 어딘가 독특한 분위기를 풍기는 이모 요시야마 카즈코에게 상담을 해 본 결과, 그것은 '타임 리프'라 불리는 능력으로 마코토 또래의 여자아이들에게 자주 있는 일이라고 아무렇지도 않게 말하는 것이다. 처음에는 적지않게 당황하기도 했지만, 원하는 시간으로 되돌아가서 하고 싶었던 일, 미처 하지 못했던 일 등 원하는 것은 모두 할 수 있게 된 마코토는 세상이 전부 자기 것이 된 듯한 기분에 푹 잠긴다.
그러나 머잖아 클래스메이트이자 친한 친구 사이인 마미야 치아키와 츠다 코스케와의 관계에 미묘한 변화가 생긴다. 치아키로부터 생각지도 못한 고백을 받게 된 마코토는 당황한 나머지 타임 리프 능력을 이용해 그 고백을 강제로 없었던 것으로 만들어 버린다. 그저 세 사람의 우정이 지금처럼 이대로 계속되었으면 좋겠다고 생각했을 뿐이었지만 마코토의 바람은 점점 엉뚱한 방향으로 흘러가 버리고, 사건의 전모를 알고 있는 이모 카즈코는 "사귀면 되지 뭘 그러니"라는 태평한 충고를 해 줄 뿐이다. 이제 마코토는 자신으로 인해 꼬여버린 관계를 풀기 위해 타임 리프 능력을 사용해 동분서주하는데...