일본군이 연합군에 항복함으로써 2차대전이 끝나고, 호주군 법무단은 남태평양 전역에 걸쳐 일본군의 만행을 조사하여 기소하는 임무를 맡았다. 인도네시아 암본섬에서의 조사도 그중 하나이다. 포로 수용소에서 저질러진 일본군의 잔혹 행위는 1946년 호주 전법재판에서 처음 밝혀졌으나, 수용소 생활의 참혹함이 만천하에 드러났다. 연합군에 생포된 일본군 장교들은 포로들에 대한 대량학살과 고의로 저지른 만행으로 기소되었다. 강직한 호주군 검사, 로버트 쿠퍼 대위(Captain Cooper: 브라이언 브라운 분)는 100명의 일본 전범들의 재판이라는 그의 경력상 거대한 도전에 직면하게 된다. 그러나 재판을 진행하면서 구파는 법과 정의는 반드시 같지만은 않다는 사실을 깨닫게 된다. 그의 상관인 프랭크 로버트 소령(Major Roberts: 존 배치 분)은 개인적인 복수심으로 덤비지 말 것을 경고하면서 방해공작을 편다. 그러나, 젊은 일본해군 중위 히데오 나나마가 곤경에 처한 쿠퍼 대위를 도우기 시작한다. 기독교 신자인 히데오는 4명의 호수 비행사 중 한 명을 처형하도록 명령을 받고, 매우 혐오스러워하면서도 군의 명령이라 어쩔 수 없이 따랐던 것이다. 히데오의 직속 상관들인 이케우찌 대위와 처형 명령을 내린 귀족 출신의 다마하시 부사령관이 최초로 쿠퍼대위에 의해 기소되었다. 그러나 나마하시 부사령관은 승거부족과 미국측 연락 장교인 베케트 소령이 그를 동경으로 귀환시킬 것을 주장하는 바람에 기각되었다.
부사령관은 히로히토 천황의 친척으로 옥스포드 대학 출신이어서 미국이 일본에서 소련의 반대파를 구축하고 친미국계 정부로 만드는 데 쓸모있을 것으로 간주되었다. 히데오는 자신이 정당한 재판을 받으리라 믿고 있지만 나마하시로부터 인도 요청을 받고 있었다. 그는 법정에서 쿠퍼 대위와 대변했다. 나마하시 부사령관이 석방되자 쿠퍼는 베케트 소령에게 나마하시의 법률 장교인 시마다와 함께 암본으로 돌아갈 것을 요청했다. 사건을 추적하기 위해 쿠퍼는 생존자들을 법정에 증인으로 세우려고 하지만 암본에서 살아남은 대부분의 군인들이 이미 집으로 돌아갔거나 증인으로 서기 힘든 상태였는데..