일본의 남쪽에 위치한 남십자섬. 일본 본토로부터 남십자섬에 도착한 신비란 소년 츠난 타쿠토는 남십자학원 고등부에 입학한다. 밝은 성격을 가진 타쿠초는 신도 스가타와 아게마키 와코 등 학교의 친구들과 금새 친해진다. 한편 이 섬의 지하에는 '사이바디'라 불리우는 거대로봇들이 봉인되어있었다. 그리고 타쿠토는 그 중 1기인 '타우반'을 기동시키는데 성공한다. 섬에는 모든 사이버디의 봉인을 풀려하는 비밀결사 '키라보시 십자단' 존재, 타우반을 자유자재로 다루는 타쿠토는 그들과 피할 수 없는 격전을 벌이게 된다.