어둠의 왕국과의 장렬한 싸움이 끝나고 2개월이 지난 지금, 세일러 요정들은 자신들이 활약했던 기억을 잃고 평범한 중학생으로 돌아가 평화로운 생활을 하고 있다. 세일러 문으로 활약했던 세라도 한나, 대니와 함께 즐거운 학교 생활을 보내고 있는데… 어느 날 우주에서 날아온 거대한 운석이, 세일러 요정들의 운명을 바꿔놓는다. 다시 시작된 가혹한 싸움의 연속, 새로운 적의 등장 그리고 의문의 소녀 꼬마 세라와 새로운 세일러 요정도 나타난다. 생명이 열리는 나무와 앨런, 앤, 그리고 블랙 문. 새로 등장한 적들은 어둠의 왕국보다 강적이다. 그러나 각성한 세일러 전사들도 파워 업 하여, 지구 평화를 지키기 위해 싸운다.
