지구 정복을 위해 먼 우주의 케론별에서 파견된 개구리 케로로와 소대원들. 그러나 갑작스러운 상관의 명령으로 지구에서 철수했던 케로로 소대원들이 어느 날 또다시 히나타 남매의 집으로 돌아온다.
