한때 고도의 문명으로 번영했던 바이오성은 그 과학력으로 물질활성화 현상을 일으키는 '바이오입자'를 만들어낸다. 하지만 바이오입자의 소유권을 두고 전쟁을 벌이다 멸망하고 만다. 바이오 입자의 평화적 이용을 바라던 바이오별 평화연합은 최후의 순간, 지구로 바이오 로보와 서포트 로보 피포를 보낸다. 그들은 우주에서 가장 아름다운 별 지구가 자신들과 같은 이유로 멸망하지 않기를 바랐기 때문이다. 그로부터 500년 후, 닥터맨이라 불리우는 미치광이 천재과학자가 메카 인간이라는 존재들을 만들어 '신제국 기어'를 세우고 세계정복을 개시한다. 과학에 의한 지구의 위기를 느낀 피포는 다섯명의 젊은이들을 소환한다. 그들은 과거, 바이오 로보가 바이오 입자를 이용해 정신과 육체를 강화시킨 젊은이들의 후예였던 것이다. 그들은 바이오입자의 힘을 이용해 '바이오맨'으로 변신해 신제국 기어와 싸우기로 결심한다.
