아스트라기우스 은하를 양분하는 길가메스와 바라란트는 전쟁을 시작한 이유마저 잃어버린 채 100년을 계속 싸워왔다. 이 100년 전쟁의 말기, 길가메스군의 병사 키리코 큐비는 아군 기지를 강습하라는 이상한 임무를 맡게된다. 이 작전에서 키리노는 군의 최고기밀인 '소체'를 목격하게 되고, 덕분에 아군에게 쫓기는 신세가 된다.