1980년대, 세계 각지에서 천재 아동들이 잇달아 태어난다. 이들은 서로 네트워크를 통해 교감하며 알케미스트 스타즈라는 그룹을 만들게 되고, 이들은 그 천재적인 두뇌를 가지고 서로 협동하여 지구의 의지를 연구하기 시작한다. 그 결과 지구가 대근원적 파멸체의 위협에 곧 직면할 것이라는 사실을 알게 된 전 세계 국가들은 이에 대응하기 위해 XIG와 GUARD를 결성하기에 이른다. 알케미스트 스타즈의 천재적인 두뇌들은 XIG와 GUARD 결성과 대근원적 파멸체의 위협에 대응할 기술들을 개발하며 이애 대비하는데... 이중 한 명인 타카야마 가무는 스스로의 의지와 지구의 의지를 동기화시키는 실험을 하던 중에 땅속 깊은 곳에 잠들어 있던 수수께끼의 거인, 울트라맨과 마주하게 된다. 그런데 울트라맨과 조우한 그 날, 대근원적 파멸체의 지구 공격이 시작되고... 가무는 울트라맨의 힘을 얻어 이들과 싸우기 시작한다.