클래스룸 크라이시스

태양계의 각 행성이 테라포밍되어 각국의 영토가 되어버린 미래. 화성에 건설된 일본의 제4 도쿄도의 키리시나시에 있는 '키리시나 과학기술학원'에는 독특한 반이 하나 존재한다. 이 반에 소속된 학생들은 낮에는 학교에서 공부를 하지만 학교가 끝나면 학교의 모체인 '키리시나 코퍼레이션'의 사원으로 발전형 시작 로켓의 개발에 착수하는 것. 이들을 '선행기술개발부 교육개발실' 약칭 'A-TEC'이라 부른다. 그러던 어느날, A-TEC에 전학생이 한명 도착한다. 바로 키리시나 코퍼레이션 경영자 가문의 한명인 키리시나 나기사. 나기사는 자신의 A-TEC의 새로운 개발부장으로 취임했으며, A-TEC의 예산소비가 심각하기 때문에 구조조정을 하겠다 선언한다. 이에 카이토를 비롯한 A-TEC의 학생들은 강력하게 반발하는데...