国家錬金術師ばかりを狙った連続殺人事件が勃発する中央（セントラル）を訪れたエドワード（山田涼介）とアルフォンスのエルリック兄弟。犯人は正体不明ながら、額に十字傷を持つことから“傷の男（スカー）”と呼ばれていた。そんななか、兄弟も命を狙われ応戦するが、その圧倒的な強さの前に機械鎧（オートメイル）を破壊され、絶体絶命となる……。